河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类

计算机高级语言编程实践报告

2021年1月

基本要求:
1 学习python的Biopython包的使用(Seq,SeqRecord,SeqFeature三个class和SeqIO模块)。编写代码,完成2,3要求。

2 利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类型为CDS的序列片段及其信息截取出来,包装为SeqRecord对象,再存储为fasta格式的文件:NC_045512.2_CDS.fasta。内容格式如下所示:

>GeneID:43740578 ORF1ab cds from NC_045512.2 site:join{
   
    
    [265:13468](

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