While we use human
designations in this paper, we note that,
according to HGNC guidelines, most vertebrates
use all uppercase letters for genes and proteins
(italics for genes), rodents use title case for
genes (uppercase for proteins), Xenopus and
zebrafish use lower case for genes and title case

人的基因：全部大写+斜体

小鼠的基因：开头大写+斜体

人的蛋白：全部大写

小鼠的蛋白：全部大写

1 一般规则

· 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号(见下文)

· 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下，第一次提到的基因/蛋白质，需要先列出经批准的名称，然后再添加 括号说明(以前被称为XXX)。例如，“我们使用抗POU5F1蛋白的抗体(以前称为OCT-4)...”。注意使用正确的符号，而不是以往的名称。

2 不同物种有不同的规则

1. 小鼠 / 大鼠 / 鸡

(1)一般命名规则(适用于小鼠，大鼠和鸡)：

· 基因的全名不用斜体，也不用希腊字母

例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)

· 基因符号不用希腊字母和连字符，使用斜体，第一个字母大写，其余小写

例如：Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子1)

· 蛋白质的名称和基因符号相同，但不用斜体，并全部大写

例如：IGF1

· mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式

例如： "... levels of* Igf1* (italicized) mRNA increased when..."

· 首次提到的突变等位基因应该详细列出

例如：Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)

· 所有字母和数字用斜体，等位基因的符号(tm1Arge)要用上标

· 经前面详细描述之后，敲除的纯合子可表示为Igf1-/- (所有字母均用斜体，并且- / -用上标)；杂合子为*Igf1 + / - *等。

(2)对于这些命名规定的详细信息，请参阅：

· (小鼠，大鼠，鸡) http://www.informatics.jax.org/

· (专门针对大鼠) http://rgd.mcw.edu/

· MGI命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml

· 基因的MGI快速指南：

http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/short_gene.shtml

1. 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种

· 完整的基因名称不用斜体和希腊字母

例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)

· 基因符号不使用希腊字母和连字符，基因符号用斜体，所有的字母用大写

例如：IGF1(斜体)

· 蛋白质的名称与基因符号相同，但不用斜体，并全部大写

例如：IGF1

· mRNA和cDNA的基因符号和规定的格式

例如："... levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when..."

更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站：

http://www.genenames.org/

1. 鱼(适用于所有的鱼)

· 完整的基因名称用斜体表示，全部用小写字母，不要用希腊字母

例如：cyclops(斜体)

· 基因符号用斜体，全部小写

例如：cyc(斜体)

· 蛋白质命名与基因符号相同，但仅首字母大写，也不用斜体

例如：Cyc

更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站：

http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg

1. 其他有用的网站：

· ExPASy(特殊蛋白质分析系统)：是瑞士生物信息学研究所(SIB)提供的蛋白质组学服务系统，可对蛋白质序列和结构以及二维PAGE进行分析：(http://au.expasy.org / )

· OMIM -孟德尔人类遗传学数据库：

(www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM )

· NCBI - Entrez Gene：提供了一个按序列和/或在NCBI's Map Viewer中查询基因的统一环境。您可以查询名称，符号，加入，出版物，GO条款，染色体数目，EC号码，和许多其他相关基因及它们的编码产物。 (www.ncbi.nlm.nih.gov/gene )

作者：爱吃海椒的妹妹
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来源：简书
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