Mendelian Sampling term是个什么鬼?

Mendelian Sampling term

Mendelian Sampling term是孟德尔抽样误差,在《动物育种与基因组学》第5.7章节中,介绍了孟德尔抽样误差这个概念:

小兔子
Fact is that each animal receives half of its genes from its father (sire) and half from its mother (dam). But you can see from the figure that with this formula you cannot predict what will be the offspring performance as you will need to know WHICH half of the genes are passed on to the offspring. And that is a chance factor, also called the Mendelian Sampling term. So a part you know: half from sire and half from dam, and the other part is the Mendelian Sampling term (MS).

上面两个大兔子是兔爸爸和兔妈妈,下面是四个小兔子。每个小兔子接受兔爸爸和兔妈妈一半的遗传物质,在图中你可以看出这一点。但是你不知道小兔子接受的是父母的哪一半遗传物质。这是一个随机因素,也叫作孟德尔抽样误差,所以小兔子真正的遗传物质包括两部分,一部分是父母本的遗传物质,另一部分是孟德尔抽样误差。

定义

Definition
The Mendelian Sampling term indicates the chance factor in distributing half the genetic material from each parent to their offspring

参考文献:Kor Oldenbroek and Liesbeth van der Waaij, 2015. Textbook Animal Breeding and Genetics for BSc students. Centre for Genetic Resources The Netherlands and Animal Breeding and Genomics Centre, 2015. Groen Kennisnet: https://wiki.groenkennisnet.nl/display/TAB/

育种值和育种值方差的构成

育种值构成:

A = 1 2 A s + 1 2 A d + A M S A = \frac{1}{2}A_s + \frac{1}{2}A_d + A_{MS}
这里,育种值由父本,母本和孟德尔抽样误差构成。

育种值方差构成:

σ A 2 = 1 4 σ A , s 2 + 1 4 σ A , d 2 + σ M S 2 \sigma_A^2 = \frac{1}{4}\sigma_{A,s}^2 + \frac{1}{4}\sigma_{A,d}^2 + \sigma_{MS}^2

在这里插入图片描述

各个元素解释:

在这里插入图片描述

遗传漂变,近交以及群体大小

遗传漂变:

遗传漂变是小的群体中,由于不同基因型个体生育的子代个体数有所变动而导致基因频率的随机波动称为遗传漂变。群体中,不同基因型个体所生子女数目不尽相同,致使子代的等位基因数发生改变,在处于相对隔离状态的小群体中会产生基因频率的随机波动。如某基因座上有A,B两个等位基因,假设A基因频率占优而B等位基因罕见,即携带B等位基因的个体很少,若这些个体无子女,则B基因在子代中便会消失。遗传漂变的结果也可使一些基因的频率升高。

遗传漂变是指基因频率由于等位基因随机传递(抽样)导致在不同世代变化的情况。两个来源:
第一:个体间基因频率变化
第二:个体内孟德尔抽样

个体间基因频率变化,是由于父母本的选择导致。
个体内基因频率变化,是由于个体在传递基因时,存在随机情况。
在这里插入图片描述

参考文献:http://nitro.biosci.arizona.edu/Nordicpdf/lecture09.pdf

一龙生九子,九子各不同

基因重组

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