python3_h2py_hdf5_遍历_查看文件结构
转载注明来源: 本文链接 来自osnosn的博客,写于 2020-03-26.
- pandas 的 hdf5 支持函数,好像没办法把 HDF5 文件的结构列出来。
- 只好使用
h5py
,把HDF5文件的结构打印出来。输出的是文本信息- python 3.6, 以下都是用
pip3 install
安装的 - h5py 2.10
- numpy 1.18.2
- pandas 1.0.3 (hdf5 的支持, 需要安装 tables)
- tables 3.6.1
- python 3.6, 以下都是用
#!/usr/bin/python3
# -- coding:utf8 --
fname='myfilename.hdf5'
import h5py
import numpy as np
def h5list(f,tab):
mysp=tab[:-1] + ' |-'
for k in f.keys():
d = f[k]
if isinstance(d,h5py._hl.group.Group):
print(mysp,'Group.',d.name,'len:%d'%len(d))
h5list(d,mysp)
elif isinstance(d,h5py._hl.dataset.Dataset):
print(mysp,'Dataset.',d.name,'(size:%d)'%d.size)
mysp1=mysp[:-1]+ ' |-'
print(mysp,end=' ')
for vv in d.dtype.names:
print(vv,end=',')
print()
#print(d[:12]) # 打印12组数据看看
else:
print('??->',d,'Unkown Object!')
f = h5py.File(fname,'r')
h5list(f,'|')
f.close()