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连接层：
MySQL的最上层是连接服务，引入了线程池的概念，允许多台客户端连接。主要工作是：连接处理、授权认证、安全防护等。
连接层为通过安全认证的接入用户提供线程，同样，在该层上可以实现基于SSL 的安全连接。
服务层：
服务层用于处理核心服务，如标准的SQL接口、查询解析、SQL优化和统计、全局的和引擎依赖的缓存与缓冲器等等。所有的与存储引擎无关的工作，如过程、函数等，都会在这一层来处理。在该层上，服务器会解析查询并创建相应的内部解析树，并对其完成优化，如确定查询表的顺序，是否利用索引等，最后生成相关的执行操作。如果是SELECT 语句，服务器还会查询内部的缓存。如果缓存空间足够大，这样在解决大量读操作的环境中能够很好的提升系统的性能。
引擎层：
存储引擎层，存储引擎负责实际的MySQL数据的存储与提取，服务器通过API 与 存储引擎进行通信。不同的存储引擎功能和特性有所不同，这样可以根据实际需要有针对性的使用不同的存储引擎。