HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\
下面有Shell Folders和User Shell Folders子项，查了MSDN最后知道Shell Folders是个废弃的子项，曾经在Windows NT使用过，现在已经不用了，而且User Shell Folders优先于Shell Folders，里面有个Startup键指示启动文件夹的位置，不知道什么软件修改或创建了Shell Folders下的Startup键，指向了同一个位置，结果两个Startup都生效导致自启动程序都执行了两遍，我把Shell Folders下的Startup删除就好了。