这个结石疾病形成的原因是比较复杂的，对于结石患者而言，只有更多的了解自己所患疾病的病因，才能更好的帮助自己的治疗。
肝内胆管结石形成的原因：
1、饮食有关。低蛋白与肝胆管结石， 低蛋白高碳水化合物饮食，β-葡萄糖醛酸酶抑制物葡萄糖二酸1-4内酯的含量减少，有利于β-葡萄糖醛酸酶使结合胆红素水解为游离胆红素，不溶于水，容易发生沉淀。
2、胆道感染。胆道感染也会引起结石，普遍认为胆道感染，特别是大肠埃希杆菌感染，产生细菌源β-葡萄糖醛酸酶，使结合胆红素水解为游离胆红素。在胆道感染时胆管炎性黏液物质增加，凝聚作用增强，加以有钙离子等金属离子的参与，形成以胆红素钙为主的胆管结石。
3、遗传因素。肝内胆管结石主要的临床表现是患侧肝区和胸背部的持续性胀痛、发热和黄疸。如果胆管内发生化脓性炎症，变会出现发热、寒颤、败血症、休克症状。胆管内结石引起的梗阻不能及时解除，会导致细菌性肝内脓肿。