R包的安装
Rstudio安装BiocManager
包
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("GEOquery")
要从GEO数据下载数据,需要使用GEOquery
包,安装BiocManager
后,我们需要把GEOquery
加载进来
library(GEOquery)
注:不能单单安装GEOquery,以上代码都要。
数据的下载
我以GEO下载GSE199775
和GPL17021
的数据为例子,代码如下:
gse0<-getGEO("GSE199775")
gpl0<-getGEO("GPL17021")
好了,他就会自己下了。