在Java中，你可以使用JSch库来以SFTP协议更新服务器上的文件。更新文件的过程涉及两个步骤：首先从服务器下载文件到本地，然后将更新后的本地文件上传回服务器。以下是一个简单的示例代码：

import com.jcraft.jsch.Channel;
import com.jcraft.jsch.ChannelSftp;
import com.jcraft.jsch.JSch;
import com.jcraft.jsch.Session;

public class SFTPFileUpdater {
    public static void main(String[] args) {
        String host = "服务器主机名或IP地址";
        int port = 22;
        String username = "用户名";
        String password = "密码";

        String remoteFilePath = "/远程文件路径/文件名";
        String localFilePath = "本地文件路径/文件名";

        try {
            JSch jsch = new JSch();
            Session session = jsch.getSession(username, host, port);
            session.setPassword(password);
            session.setConfig("StrictHostKeyChecking", "no");
            session.connect();

            Channel channel = session.openChannel("sftp");
            channel.connect();

            ChannelSftp sftpChannel = (ChannelSftp) channel;
            // 下载服务器上的文件到本地
            sftpChannel.get(remoteFilePath, localFilePath);

            // 假设你在本地修改了文件

            // 将更新后的本地文件上传回服务器
            sftpChannel.put(localFilePath, remoteFilePath, ChannelSftp.OVERWRITE);

            sftpChannel.disconnect();
            session.disconnect();

            System.out.println("文件更新成功！");
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

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请确保在运行代码之前已经将jsch.jar库添加到你的项目中。还需要替换代码中的服务器主机名、端口、用户名、密码以及远程和本地文件路径。在运行此代码之前，确保服务器上存在要更新的文件，并且你已经对本地文件进行了修改。

注意：为了使该代码能够顺利执行，确保服务器上已经安装并运行了SSH服务，并且允许使用SFTP协议进行文件传输和删除操作。