import numpy as np
2. Apply np.expm1
to reverse the transformation:
rawdata = np.expm1(adata.X)
np.expm1
函数在计算指数的时候已经减去了 1,所以在进行逆转换时,不需要再次减 1。
import numpy as np
data = np.array([0, 1, 2])
# Log1p transformation
log1p_data = np.log1p(data) # Output: [0. , 0.693, 1.099]
# Reversing the transformation using np.expm1
reversed_data = np.expm1(log1p_data) # Output: [1. , 2. , 3. ]
# Notice that no additional subtraction of 1 is needed.
那逆转之后的数据,可以看作是原始的counts数据吗
是的,逆转之后的数据可以被看作是原始的 counts 数据。 log1p 变换只是将原始数据的每个值都乘以了 e,并减去 1。因此,逆变换之后的数据将恢复到原始数据的值。
但是,在实际应用中,逆变换之后的数据可能会与原始的 counts 数据存在一些细微的差异。这是因为 log1p 变换会导致数据的噪声增大。因此,在使用逆变换之后的数据时,需要注意数据的准确性。
以下是一些使用逆变换之后的数据的注意事项:
- 在使用逆变换之后的数据进行统计分析时,需要注意数据的噪声。
- 在使用逆变换之后的数据进行可视化时,需要注意数据的准确性。
如果需要对数据进行精确的分析,建议使用原始的 counts 数据。