最近做图像的时候,突然有个idea,需要进行聚类,其实算法很简单,但是当时很急,就直接使用了scipy的cluster。
使用起来其实很简单,但是中文的文章很少,所以就简单的介绍一下,感兴趣的也可以自己去看一下英文的文档:http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/cluster.html。
这是我从stackoverflow看到的一个demo,如果只是简单的使用cluster,这样就可以了。
import scipy
import scipy.cluster.hierarchy as sch
import matplotlib.pylab as plt
scipy.randn(100,2)
d = sch.distance.pdist(X)
Z= sch.linkage(d,method='complete')
P =sch.dendrogram(Z)
plt.savefig('plot_dendrogram.png')
T = sch.fcluster(Z, 0.5*d.max(), 'distance')
#array([4, 5, 3, 2, 2, 3, 5, 2, 2, 5, 2, 2, 2, 3, 2, 3, 2, 5, 4, 5, 2, 5, 2,
# 3, 3, 3, 1, 3, 4, 2, 2, 4, 2, 4, 3, 3, 2, 5, 5, 5, 3, 2, 2, 2, 5, 4,
# 2, 4, 2, 2, 5, 5, 1, 2, 3, 2, 2, 5, 4, 2, 5, 4, 3, 5, 4, 4, 2, 2, 2,
# 4, 2, 5, 2, 2, 3, 3, 2, 4, 5, 3, 4, 4, 2, 1, 5, 4, 2, 2, 5, 5, 2, 2,
# 5, 5, 5, 4, 3, 3, 2, 4], dtype=int32)
sch.leaders(Z,T)
如果想要了解更多一些的话,可以参考 http://nbviewer.ipython.org/github/herrfz/dataanalysis/blob/master/week4/clustering_example.ipynb
这篇文章其实写的已经非常棒了,虽然文件我没有能够成功down下来。