通过网上资料该文章 http://www.cncvs.com/html/bencandy.php?fid=5&aid=22
问题解决。
主要问题是：WCE 上面安装的.NET框架与C#编译时的要安装的框架版本不匹配。
在WCE上面把已经安装好的.NET框架卸载，然后让C#布署自己的框架，可以解决。
布署完成后，把生成的.EXE文件Copy出来。CE设备冷启动，把C#布署的框架卸载，把原来的框架再安装上去，已经生成的.EXE文件可以直接在该框架上面直接运行，（前提是原来的.NET框架和你的程序匹配，程序可以运行，只是C#编译器中断点无法调试）