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引言
高通量测序每测完一个碱基，会给出一个相应的测序质量值，用于衡量测序仪的准确度。测序错误率是在碱基识别过程中通过一种判断发生错误概率的数学模型计算得到的，再根据测序错误率与碱基的测序质量值之间的转化关系，最终得到测序质量值。
公式
假定碱基的测序错误率为：Perror
质量值为：Qphred (Phred quality score)
公式为：Qphred = -log10Perror
即：质量值是测序错误率的对数（10为底数）乘以-10（并取整）
Q20：碱基的测序错误率为1/100
Q30：碱基的测序错误率为1/1000
Q20和Q30的比例常常被我们用来评价某次测序结果的好坏，比例越高就越好
最好是达到Q20的碱基要在95%以上（最差不低于90%），Q30要求大于85%（最差也不要低于80%）。