Kaplan-Meier plot cutoff选择

其他 2018-12-09 20:06:34 阅读次数: 0

Kaplan-Meier plot在生物医学中很常见，主要用来做预后分析，比如可以根据gene A的表达量把病人分成两组，用KM plot去比较哪组病人预后好，进而可以得出gene A的表达量高低与病人预后好坏相关性的结论。

画KM plot时，有时候会比较纠结怎样对病人进行分组，如何来设置分组的cutoff。经过大量的文献调研，我发现下面几条规律：

1，在有充分的证据定义gene A的表达量在某个范围算高表达或低表达时，可以用这个预先定义的标准对样本进行分类；

2，大多数情况下，根据gene A表达量从低到高对样本进行排序，取前50%为低表达，后50%为高表达，然后画KM plot；

3，少数paper也会选一些其它的cutoff，比如前1/3和后2/3，前10%和后10%（中间80%的数据去掉），貌似也没有足够的证据证明这种分法不对。

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转载自blog.csdn.net/linkequa/article/details/83550441
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