R语言安装并使用Biobase包

通常在R中安装包时,可以直接在控制台调用install.package()函数进行安装,但Biobase包比较特殊,属于Bioconductor的一部分,直接使用该函数安装会失败,需要首先安装Bioconductor,有的地方说使用命令source("http://bioconductor.org/biocLite.R")可以安装,但我在安装过程中出现了以下报错:Error in download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
  download from 'https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc/src/contrib/BiocInstaller_1.28.0.tar.gz' failed ,同时出现了提示信息:'biocLite.R' failed to install 'BiocInstaller', use 'install.packages("BiocInstaller", repos="https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc")' or 'install.packages("BiocInstaller", repos="http://bioconductor.org/packages/3.6/bioc")',此时按照提示信息进行操作,执行install.packages("BiocInstaller", repos="https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc"),即可成功安装。

安装之后有的地方说可以直接使用biocLite("Biobase")安装Biobase,但我再次遇到了报错信息:Error in biocLite("Biobase") : 没有"biocLite"这个函数,也就是找不到bioLite这个命令,此时需要对该函数进行限定,使用BiocInstaller::biocLite("Biobase"),即可成功安装Biobase.

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