ARCHS4 - 人鼠RNA-seq
TPIA - 安徽农大 茶树基因组
TMDB - 安徽农大 代谢物
Tea plant Genome Database - 昆明植物研究所 基因组
两套基因组及注释文件的评估,到底用哪一个?
实验设计 - 方差分析,学Fisher
评价主流处理对茶树次级代谢的影响(看哪个的处理最多)
问题:
一个未知的植物的基因是怎么注释的?
如何把RNA-seq得到基因的表达?如何得到定量的信息?
文章:
Massive mining of publicly available RNA-seq data from human and mouse
两篇茶树基因组的文章:
The Tea Tree Genome Provides Insights into Tea Flavor and Independent Evolution of Caffeine Biosynthesis - Mol Plant