python图工具中基于随机块模型动态网络社团检测

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这是“政治博客圈和2004年美国大选”中的政治博客网络图,但是边缘束是使用随机块模型确定的(注:下图与图相同(即,布局和数据相同))。 Tiago论文中的5-我只是在上面放了一个黑色背景 。

边缘配色方案与Adamic和Glance的原始论文中的相同,即每个节点对应一个博客URL,颜色反映政治取向,红色代表保守派,蓝色代表自由派。橙色边从自由派博客到保守派博客,紫色边从保守派到自由派(参见Adamic和Glance中的图1)。

颜色方案与原始论文中的颜色方案相同,即每个节点对应一个博客URL,颜色反映政治取向,红色代表保守派,蓝色代表自由派。橙色边从自由派博客到保守派博客,紫色边从保守派到自由派(参见Adamic和Glance中的图1)。绘制了所有1,490个节点和19,090条边。

每个博客的网址都在每个节点旁边绘制,这是一个特写:

import graph_tool.all as gt
import math

g = gt.collection.data["polblogs"] # http://www2.scedu.unibo.it/roversi/SocioNet/AdamicGlanceBlogWWW.pdf

使颜色正确需要一些调整:

#use 1->Republican, 2->Democrat
red_blue_map = {1:(1,0,0,1),0:(0,0,1,1)} plot_color = g.new_vertex_property('vector<double>') g.vertex_properties['plot_color'] = plot_color for v in g.vertices(): plot_color[v] = red_blue_map[g.vertex_properties['value'][v]]

为了使用分层边缘捆绑算法,我们首先需要进行某种聚类。一种明显的方法是根据其政治隶属关系为每个节点分配一个群集:

这些集群用于形成一个层次结构,该层次结构使人们可以轻松确定标准的树布局(如下图所示)。通过沿树内插来绘制层次边缘束。

这是上图使用的树:

最后,我们设置文本旋转并保存图形:

#labels
text_rot = g.new_vertex_property('double')
g.vertex_properties['text_rot'] = text_rot
for v in g.vertices(): if pos[v][0] >0: text_rot[v] = math.atan(pos[v][1]/pos[v][0]) else: text_rot[v] = math.pi + math.atan(pos[v][1]/pos[v][0]) gt.graph_draw(g, pos=pos, vertex_size=10, vertex_color=g.vertex_properties['plot_color'], vertex_fill_color=g.vertex_properties['plot_color'], edge_control_points=cts, vertex_text=g.vertex_properties['label'], vertex_text_rotation=g.vertex_properties['text_rot'], vertex_text_position=1, vertex_font_size=9, edge_color=g.edge_properties['edge_color'], vertex_anchor=0, bg_color=[0,0,0,1], output_size=[4024,4024], output='polblogs.png')

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