Android应用程序一般包含在一个单一的文件夹中，即每一个Android应用程序是一个独立的工程，包含了以下文件：

1：Android.mk：统一工程文件，在SDK开发中可以不需要；

2：AndroidManifest.xml：工程描述文件，在其中定义了各种组件；

3：Java源代码：按照Java包的方式来组织目录结构，包括各个Java类的源代码；

4：资源文件：包含XML文件、图片、原始数据文件等，其中表示界面情况的布局（Layout）文件比较重要。

在编译Android应用程序的过程中，Java源代码使用Sun JDK将Java源程序编译成Java字节码文件（多个后缀名为.class的文件），这一步骤和标准的Java一致，然后通过Android自带的工具软件dex把所有的字节码文件转成dex文件（单一文件classes.dex）。

AndroidManifest.xml文件经过Android打包工具（aapt）处理后形成二进制格式AndroidManifest.xml文件，实质的内容与以前相同。
各个资源文件也经过aapt处理，其中布局等文本文件处理成二进制文件，图片等文件保持不变。
最后将这三个部分组合成一个应用程序包（*.apk）。AndroidManifest.xml描述文件、Java源文件、资源文件是Android应用程序的三个部分；在编译之前的工程中是这三个部分，在编译之后APK包依然是由这三个部分组成的。

Android源文件经过了标准的Java编译器的编译，又经过了dx工具的处理，标准的Java字节码作为整个Android编译的中间过程，最终生成的dex文件（classes.dex）是一个单一文件，将工程中所有的Java源代码文件对应的字节码集成在一起。资源文件和AndroidManifest.xml文件通过aapt工具进行处理。