山威高性能计算课程HPL & HPCC软件快速安装脚本

写这个脚本是为了方便女朋友安装。
本人水平有限,如有疏漏还请指出。

这个文档提供了一个脚本,可以帮助你很轻松地安装 2020 年第一学期贺红老师的 18 级高性能计算课程开始所需要的HPLHPCC两个 benchmark 工具,请按照如下步骤进行,除此之外不需要下载任何BLAS等其他软件包

写了一个编写过程和原理解释,有兴趣的同学可以看一下,一起交流^ ^

点这里看编写过程和原理解释
或者点这里

【重要】3月14日 18:40更新:

之前由于个人疏忽,没仔细看账号主目录下的.bashrc文件,因此造成断开再登录时测试报错,提示"Error While Loading Shared Libraries: libiomp5.so",解决方法如下:

  • 如果之前未安装,新的脚本已经更新,无需操作。
  • 如果之前使用脚本安装过:
  • 临时方案:每次登录时,执行(在哪个目录执行无所谓)
# 取出/home/train/.bashrc中的命令并执行
source ~/../bashrc
优点 不改变shell登录时的配置文件
缺点 只在一次登录中有效,断开连接(注销)后即失效
  • 永久方案:登录,进入到自己学号的目录,执行
# 用/home/train/.bashrc覆盖用户主目录下的.bashrc
cp ~/../bashrc ~/.bashrc

下次再登录的时候就不会出现问题了。

优点 一次修改,永久生效(当然也可以再改回去)
缺点 其实没啥大缺点

对于永久方案,我认为是没有危害的。因为/home/train/.bashrc/home/train/stuxx/.bashrc两者仅有三行区别,这三行的作用是将相关库的目录加入环境变量中。而由于.bashrc是每次登录终端时执行,因此以后如果不想要这几个环境变量了,再用vim编辑一下,删掉后面三行即可。

3月14日 11:40更新:部分账号下由于之前安装更改了环境变量导致错误。加上了修复MKL等环境变量的语句。

1. 准备工作

  1. 登录学校 VPN,并使用 Xshell 等 ssh 连接软件连接到学校超算节点

  1. 确认你已经创建了你自己的目录,并进入你的目录,请执行:
cd 201800XXXXXX

结果如下图所示,注意$符号前出现了你的学号

2. 下载脚本并使用

  1. 请务必确认你现在处于你自己的目录(以你学号命名的目录)下,执行
# 注意:此ftp账号无密码,复制时确认最后没有空格
wget ftp://[email protected]/install-onekey.sh --ftp-password=

# 获取执行权限并执行

chmod +x install-onekey.sh
./install-onekey.sh

  1. 按照提示输入 y,脚本自动完成下载、解压、编译等任务
    耐心等候一小会,坐和放宽,最后结果如下图,不出现 error 提示就对

更细致地说,满足以下条件,代表程序编译成功:

目录 201800xxxxxx/hpl-2.3/bin/sduwhhpl 下,有HPL.datxhpl两个文件,表示HPL编译成功

目录 201800xxxxxx/hpcc-1.5.0 下,有hpcc文件,表示 HPCC 编译成功

3. 测试

具体测试目录见上面

测试 HPL

#在 HPL.dat 文件所在目录(详细目录见上面)下执行 xhpl 程序

mpirun -np 4 ./xhpl # 4个CPU并行

测试 HPCC

#在hpcc所在目录(详细目录见上面)执行下列操作
cp \_hpccinf.txt hpccinf.txt
mpirun -np 4 ./hpcc
# 运行结束后会在当前目录生成一个 hpccoutf.txt 的结果文件

以上就是全部的安装过程了,祝愿安装顺利。


4. 一些发现

HPL(High Performance Linpack),是用于并行计算的高性能计算测试软件。当前最新版本是2.3。HPCC 本质上就是使用的HPLHPCC 1.5之后就不再更新,HPCC 集成的是HPL 2.0因此两者的编译文件非常相似。只需要修改一点地方。区别仅在于HPCC不需要在配置中指定HPL目录,因此那部分不填。

HPL 的编译配置文件,我是基于setup目录里的Make.Linux_Intel64修改,使用此模板的原因是学校集群使用的是 Xeon E5-2620 处理器。我们所在的 train 目录下已经写好了mklmpi的环境变量,因此不需要再下载blasmpi软件包。

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