使用3D Slicer的Python Interactor 命令批量载入dicom文件（load DicomData）

博主最近在研究医学影像相关内容，也阅读了官方文档和很多博客，发现3d slicer内置python命令行对批量载入dicom文件和批量保存scene很有帮助。

1、优质的3D Slicer操作、编程博客

1. 3d slicer软件的入门与基本控制
   https://blog.csdn.net/shenziheng1/article/details/76392120
2. slicer官方文档 （网站加载速度很慢，纯英文，阅读能有更好的理解）
   https://www.slicer.org/wiki/Slicer3:python
   https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly
   https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.10/ScriptRepository#Toolbar_functions（这个是最完整最详细的DICOM模块文档）
3. 在slicer中编程
   https://blog.csdn.net/liaopiankun0618/article/details/84455220
4. 介绍3D Slicer的另一个身份：医学影像IDE
   https://cloud.tencent.com/developer/news/304961

2、Load（载入）功能

（1）官方文档说明

此代码将所有DICOM对象从文件夹加载到场景中。将评估所有已注册的插件，并使用置信度最高的插件来加载数据。文件被导入到临时DICOM数据库中，因此当前的Slicer DICOM数据库不会受到影响。

（2）python代码

dicomDataDir = "c:/my/folder/with/dicom-files" #dicom源文件夹
loadedNodeIDs = [] # this list will contain the list of all loaded node IDs
from DICOMLib import DICOMUtils
with DICOMUtils.TemporaryDICOMDatabase() as db:
  DICOMUtils.importDicom(dicomDataDir, db)
  patientUIDs = db.patients()
  for patientUID in patientUIDs:
    loadedNodeIDs.extend(DICOMUtils.loadPatientByUID(patientUID))

回车，执行命令。（如果文件数过多，或者电脑配置较低，运行速度很慢）

运行结果会报错，但是不影响影像的形成和slicer软件中dicomData的正常导入。

3、Save功能（保存为各种格式，如mhd.）

此部分官方文档没有对应代码，博主还没有认真阅读完全部文档，to be continued…

参考文献

[1]https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly