题目
poj1080

题意：
给出两个字符串，求它们匹配成功后（两个字符串长度要相等，不相等的话可以在较短的字符串加字符 ’-‘ 增长）的最大得分。
$$得分=\sum _{i=0}^{str1.lenght()-1}\sum _{j=0}^{str2.lenght()-1}cnt(i,j)$$
cnt[ ][ ]：

思路：
Needleman - Wunsch算法
dp过程：

代码

#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <map>
#define DEBUG freopen("_in.txt", "r", stdin); freopen("_out1.txt", "w", stdout);
#define CASE int t; cin >> t; while (t--)
using namespace std;
const int MAXN = 1e2 + 10;
char a[MAXN], b[MAXN];
int dp[MAXN][MAXN];
map<char,int> m;
int cnt[5][5] = {
    
    {
    
    5, -1, -2, -1, -3},
				{
    
    -1, 5, -3, -2, -4},
				{
    
    -2, -3, 5, -2, -2},
				{
    
    -1, -2, -2, 5, -1},
				{
    
    -3, -4, -2, -1, 0}};
void init(){
    
    
	m['A'] = 0;
	m['C'] = 1;
	m['G'] = 2;
	m['T'] = 3;
	m['-'] = 4;
}
void solve(){
    
    
	int lena, lenb;
	scanf("%d %s", &lena, a);
	scanf("%d %s", &lenb, b);
	for (int i = 0; i <= lena; i++)
		for (int j = 0; j <= lenb; j++)
			if (i == 0 && j == 0)
				dp[i][j] = 0;
			else if (i == 0)
				dp[i][j] = dp[i][j-1] + cnt[m['-']][m[b[j-1]]];
			else if (j == 0)
				dp[i][j] = dp[i-1][j] + cnt[m[a[i-1]]][m['-']];
			else
				dp[i][j] = max(dp[i-1][j-1]+cnt[m[a[i-1]]][m[b[j-1]]], max(dp[i][j-1]+cnt[m['-']][m[b[j-1]]], dp[i-1][j]+cnt[m[a[i-1]]][m['-']]));
	printf("%d\n", dp[lena][lenb]);
} 
int main(){
    
    
	init();
	CASE solve();
	return 0;
}