北京中科云畅应用技术研究院
CCATRI-07-18720
关于举办“高通量测序应用最新技术与数据分析”培训通知
尊敬的 老师:
随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。为进一步推动我国生物信息学方面的发展,提高从业人员的技术水平,由北京中科云畅应用技术研究院举办“高通量测序应用最新技术与数据分析”高级培训班,并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办,具体事宜通知如下:
一、课程特点:
1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘;
2、结合各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;
3、经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案;
4、理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;
5、精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会;
6、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。
二、培训对象:
大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点: 2018年7月20日——7月24日 昆明 (西双版纳大厦)
(时间安排:第1天报到,授课4天)
四 、培训内容
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章节 |
内 容 |
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7.21 第一天 |
生物信息学介绍与前沿技术动态 |
3900元/人 |
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新物种基因组测序策略及基因组文章构成分析 |
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新物种基因组测序策略及基因组文章构成分析 |
4、基因组文章构思的关键基本共识
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微生物基因组学
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1、微生物基因组研究概况
3微生物基因组研究的意义
6、泛基因组分析流程 宏基因组/宏转录组的应用
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7.22 第二天 |
Linux命令简介 |
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R语言基础以及ggplot2绘图 |
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7.23 第三天 |
使用R语言进行生物信息学相关的分析
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1、高通量测序RNA-seq数据的格式、质量值计算、优缺点 2、无参考基因组-数据拼接软件介绍 3、表达量计算软件介绍 上机操作实习: (i)利用bioconductor包EdgeR进行差异基因分析 (ii)利用bioconductor包degeR进行差异基因分析 (iii)利用热图进行聚类分析 (iv)GO、KEGG等功能聚类分析及用perl语言实现 BioEdit、WEGO等常用生物软件介绍
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7.24 第四天 |
生物信息学专业常用工具及绘图方法 |
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900元/人 |
生物信息学专业常用工具及绘图方法 |
1、Perl语言入门 2、基因组大小评估 3、基因组拼接质量评估 (i) N50统计 (ii) 根据比对结果统计深度和覆盖度 (iii)碱基GC含量等信息统计 4、基因结构预测结果展示和提取 (i)GFF文件介绍 (ii)GFF内容提取 5、使用circos绘制基因组圈图 |
五、主讲专家:
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室 胡松年老师,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。
六、关于证书:学员经培训考试合格后可以获得:
- 由北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书。
- 注:请学员提供身份证复印件一张。
- 报名办法及费用:
前三天课程费用3900元/人,为必选。最后一天课程900元/人,可按照需求选择,四天课程共4800,选择全部课程可优惠500元,优惠后价格4300元(含报名费、培训费、资料费、等相关费用)食宿统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请邮件回复至会务组。微信:a15222686823