北京中科云畅应用技术研究院
CCATRI-07-18721
关于举办“精准医学与药物基因组测序应用最新技术与数据分析”高级培训班
各有关单位:
近年来，随着我国精准医疗产业迅速发展，精准医疗技术的研究与应用取得了长足的进步。精准医学研究作为科技部国家重点研发计划重点专项，对构建国家大型健康队列和重大疾病专病队列，建立多层次生物医学大数据共享平台，建立大规模疾病预警、诊断、治疗与疗效评价体系等方面具有重要意义，是显著提升人口健康水平、实施健康中国战略过程中不可或缺的一部分。
精准医学的最终目的是实现对于疾病和特定患者的个体化精准治疗，提高疾病的诊治与预防效益，而精准用药正是实现这一目标的重要环节。在医药分开持续推进的过程中，药师转型的速度明显加快，药师群体也希望提升自身业务水平以适应这次改革浪潮。同时，近几年基因检测飞速发展，测序技术的突破也带动了药物基因组学的发展，这为临床提出了更高要求。为进一步推动我国生物信息学方面的发展，提高从业人员的技术水平，由北京中科云畅应用技术研究院举办“高通量测序应用最新技术与数据分析”高级培训班，并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：
一、课程特点：
1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘；
2、结合各大项目实践经验，详细介绍多种数据分析软件的使用方法；
3、理论课与实践课相结合，讲师与学员研讨的方式进行；
4、精心挑选相应的上机软件，为每位学员提供实际操作的机会；
6、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。
二、培训对象：
生命组学科、精准医学和中医药研究机构、临床科研人员，大学、医院等专家学者。大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、计算机科学的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事医学、生物、生命科学、相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点： 2018年8月16日——8月19日 北京
（时间安排：第1天报到，授课3天）
四 、培训内容
| 章节 |
内 容 |
| 基因组学技术在临床中的应用 |
1.外显子捕获测序（WES）技术 2.WES筛选疾病致病基因策略 3.基于NGS的肿瘤个体化数据分析 4.临床案例分析 |
| 基因组学技术在致病基因发现 |
1.药物基因组学分析 2.临床案例分析 3.应用二代测序技术研究发病机理、开发临检标志物 |
| 宏基因组与精准医疗 |
1.1. 为什么肠道基因组这么热？为什么肠道菌群这么重要？肠道菌群在什么情况下不重要？以深入浅出的语言介绍宏基因组在精准医疗中的重要意义。 1.2. 肠道菌群实验设计基本套路详解。以精彩实例解析CNS肠道菌群文章的基本套路，实验设计基本原则和应该避免的误区。 1.3. 宏基因组分析的基本任务，工作流程和基本工具。以生物学问题为导向，把宏基因组分析的流程按任务进行划分，介绍如何选择合适的工具、流程。 1.4. 宏基因组的未来与挑战。分析宏基因组领域急待解决的问题和未来的发展方向。 |
| 预后与生存分析 |
1.1. 从预后与生存分析的基本任务说起：生物标志物的挑选。介绍常见肿瘤预后标志物；常用标志物筛选方法、策略；如何用常规和机器学习方法筛选生物标志物。 1.2. 预后与生存分析常见概念介绍，包括hazzard ratio等。 1.3. 如何确定预后与生存分析所用样本数量？ 1.4. 介绍常用的分析工具，包括R和扩展包survival、survminer、OIsurv和KMsurv等，图形工具graphpad；向非编程用户介绍如何用Excel及其它图形化软件进行meta分析、作图；介绍简单的编程方法。 |
| R语言绘图（ggplot2）以及Linux常用基本命令
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1.R语言简洁以及安装 2.Ggplot2包安装以及基本图形绘制 3.Linux常用命令简介 |
| 16S分析软件QIIME上机操作 |
1. 笔记本电脑配置要求建议笔记本内存4G以上，64位操作系统
2. 针对16S rDNA amplicon sequencing分析 2.1. 虚拟机安装：Virtual Box 2.2. 16S分析运行环境搭建：QIIME Virtual Machine 2.3. 实例演示及结果展示 数据预处理 OTU 聚类 物种注释 OTU table生成 α多样性分析 序列比对 构建进化树 β多样性分析
3. 针对shotgun sequencing分析（只做流程演示讲解） 3.1. 序列质量控制：fastqc 3.2. 序列拼接 3.3. 基因预测及丰度分析 3.4. 物种注释 3.4. 功能注释 3.5. MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍
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| 变异位点分析软件GATK上机操作 |
1.基本信息分析： raw data 数据整理及数据质量评估； 2.数据通过GATK, SAMtools 等检测SNP 和InDel 变异信息； 3.将SNP 和InDel 与dbSNP 和千人基因组数据进行比对分析； 4.变异所在基因的功能注释；
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| 生物信息学专业常用工具及绘图方法 |
泛基因组学分析（PanGP） |
五、主讲专家：
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室 胡松年老师及其团队，拥有丰富的科研及工程技术经验，长期从事生物信息领域项目研究，具有资深的技术底蕴和专业背景。
六、关于证书：学员经培训考试合格后可以获得：
- 由北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书。
- 注：请学员提供身份证复印件一张。
- 报名办法及费用：
学费3900元（含报名费、培训费、资料费、等相关费用）食宿统一安排，费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训，各单位也可直接报名参加，报名回执表请邮件回复至会务组。
| 参会学员信息表 |
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邮 编 |
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电话 |
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传 真 |
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| 学员姓名 |
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学历 |
身份证号 |
手 机 |
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| 费用合计 |
万 仟 佰 拾 元 |
汇款日期 |
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| 会场选择 |
北京 |
是否住宿 |
□是 □否 |
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| 户 名：北京中科云畅应用技术研究院 开户行：招商银行股份有限公司北京丰台科技园支行 账 号：110929081110801 |
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| 想了解问题： |
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| 开具发票需要提供以下信息： 单位名称： 纳税人识别号： 地址、电话： 开户行及账号: 发票内容：(培训费、会议费) |
参会联系人： 报名电话： |
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