格式：
bowtie2-build XX.fa 目录
1）使用方法： bowtie2-build <要生成的索引文件前缀名> <目录>:
tool/bowtie2-2.2.1/bowtie2-build $Genome P_heterocycla/P_heterocycla
2）参数说明：genome.fa是fasta文件；
genome是要生成的索引文件的前缀名；
bowtie2index是一个文件夹，用来存放索引文件，方便日后查看和使用；
注意：程序运行完后genome.fa文件要放在bowtie2index索引目录中，tophat2软件才能正确运行