- 在生物信息学中,距离矩阵用来表示与坐标系无关的蛋白质结构,还有序列空间中两个序列之间的距离。这些表示被用在结构比对,序列比对,还有在核磁共振,X射线和结晶学中确定蛋白质结构。
- 基于DNA分子标记数据构建系统进化树的新策略DSP+MEGA
- MEGA使用手册(没实验成功):
https://wenku.baidu.com/view/900906f2f90f76c661371ad8.html
导入距离矩阵:#序列格式/txt格式[1]#名字/测序图谱格式直接导入
Pairwise Distance(遗传距离矩阵):Lower Left Matrix(下三角矩阵),Upper Right Matrix(上三角矩阵)
点击“choose model”:
点击“Compute Pairwise”:
Bootstrap(自展法检验) - 系统发育树的构建:MEGA
https://wenku.baidu.com/view/c9981373876fb84ae45c3b3567ec102de3bddf03.html
(未实验成功) - 用距离矩阵在mega建系统树的方法:
步骤http://ishare.iask.sina.com.cn/f/14101130.html - 基于距离矩阵的进化树构建方法研究(硕士毕业论文)
距离矩阵(暂存)
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转载自blog.csdn.net/weixin_43643082/article/details/84557163
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