遗传算法 模拟退火 找位置
半经验的自由能计算方法 算匹配

方法：基于格点能量的计算方法和有效的扭转自由度搜索方法

下载autodock+ADT(可视化)+python 2.5
The Scripps Research Institute+adt.bat copy到同一工作文件夹下

pdb format ，mol2，ZINC：http://zinc.docking.org/

蛋白加氢，计算电荷，添加蛋白类型，保存PDBQT

小分子在Ligand里打开，Check Total on Residues均分电荷，Torsion tree>Choose Torsion看能旋转的键，保存PDBQT

Grid:打开蛋白pdbqt，打开小分子set map types，open ligand，grid box，output，save GPF .gpf，Run:autogrid，Log Filename栏目输出glg后缀，加入cmd，launch；
Docking:选蛋白set rigid filename，和小分子open ligand，选择算法，参数，导出相同算法output .dpf，run：autodock，处理完得dlg文件；