对genotype的等位型进行计数，需要用到以下参数：
--freq Allele frequencies
--counts Modifies --freq to report actual allele counts
具体用法如下命令：
/plink-1.07-x86_64/plink --freq --counts --noweb --bfile file --make-bed --out file
注意：这里用到的是plink的1.07版本，如果是1.9或者2.0版本，则命令可能会有些许的改动，具体参考官网。
参考：http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/reference.shtml