本文是自己的一些随笔，记录一些比较关键的，以后可以用到的知识点。

python中使用参数

from argparse import ArgumentParser

parser = ArgumentParser() # 创建一个解析对象
# 参数一般包括：短参数、长参数、数据类型（type）、默认值（default）、帮助信息（help）、参数值范围（choices）、是否必须（require）、action。
# action选项中常用的是 action="store_true"，它表示只要运行时该变量有传参就将该变量设为True
# 具体例子如下
parser.add_argument('-b','--batch_size', type=int, default=5, help="Batch size in training.", choices=[1,2,3,4,5], require=True, action='store_true') #添加命令行参数和选项
parser.parse_args() # 进行解析
batch_size=args.batch_sise

# 若文件名为test.py，则在命令行中输入 test.py --help 即可查看所有支持的参数

python处理 json

import json

'''
主要使用两个函数：
	json.dumps()：用于将python的数据类型转化为json中的字符串
	json.loads()：用于将json中的字符串转化为python的数据类型
'''

'''
json.dumps(obj,sort_keys=False)	# sort_keys参数可以用来决定转换后的json是否按key值排序
	python 原始类型向 json 类型的转化对照表：
		python              json
		--------------------------
		dict                object
        list, tuple	        array
        str, unicode        string
        int, long, float    number
        True                true
        False               false
        None                null	
'''

'''
json.loads(obj)
	json 原始类型向 python 类型的转化对照表：
		json                python
		-----------------------------
        object              dict
        array               list
        string              unicode
        number (int)        int, long
        number (real)       float
        true                True
        false               False
        null                None	
	
'''

python中*arg和**kwargs的区别

这两个是python中的可变参数。*args 表示任意多个无名参数，它是一个tuple；**kwargs 表示任意多个关键字参数，它是一个dict。当 arg、*args、**wkargs 同时使用时，必须按照该顺序，否则会报错。

def foo(*args, **kwargs):
    print 'args = ', args
    print 'kwargs = ', kwargs
    print '---------------------------------------'
    return kwargs # 返回值是一个字典

if __name__ == '__main__':
    foo(1,2,3,4)
    foo(a=1,b=2,c=3)
    foo(1,2,3,4, a=1,b=2,c=3)
    foo('a', 1, None, a=1, b='2', c=3)

以上代码的输出为：

args =  (1, 2, 3, 4) 
kwargs =  {
    
    } 
--------------------------------------- 
args =  () 
kwargs =  {
    
    'a': 1, 'c': 3, 'b': 2} 
--------------------------------------- 
args =  (1, 2, 3, 4) 
kwargs =  {
    
    'a': 1, 'c': 3, 'b': 2} 
--------------------------------------- 
args =  ('a', 1, None) 
kwargs =  {
    
    'a': 1, 'c': 3, 'b': '2'} 
---------------------------------------

python中NiBabel模块的使用

NiBabel模块可以对常见的医学和神经影像文件格式进行读写，比如.nii.gz格式的文件。

# 用pip install nibabel来安装
import nibabel as nib

img = nib.load(file_name) #加载图像
img.shape #图像形状
print(img.affine) #把图像矩阵转换为RAS+坐标系的仿射变换矩阵
print(img.header) #图像的头，包含很多信息
print(img.header.get_data_shape()) #图像矩阵的shape
print(img.header.get_data_dtype()) #图像矩阵的数据类型
img.get_data() #获取图像数据
img.affine.shape #仿射变换
img.to_filename(save_path) #保存图像
nib.save(img, save_path) #保存图像

python中的generator

generator是一个特殊的函数，它与普通函数相比有以下区别：

• generator函数包含一个以上的yield声明，用yield来返回值；
• generator函数被调用的时候，会返回一个iterator对象，但是函数并不会立即开始执行；
• __iter__()和__next__()方法被自动实现，所以可以使用next()函数对返回的此iterator对象进行迭代，也可直接使用for循环来迭代；
• 一旦一个generator 执行到yield语句，generator函数暂停，程序控制流被转移到调用方；
• 在对generator的连续调用之间，generator的本地变量和状态会被保存；
• 最终，generator函数终止，再调用generator会引发StopIteration异常；

generator函数中也允许使用return，但是return 后不允许有返回值。return和yield的区别在于，return声明彻底结束一个函数，而yield声明是暂停函数，保存它的所有状态，并且后续被调用后会继续执行。

L = [x * x for x in range(10)] #返回的是列表
g = (x * x for x in range(10)) #返回的是generator

python知识点

1. 当有函数嵌套时，外层函数的返回值往往是内层函数，并且在内层函数只可以在外层函数里访问
2. 通过 @property 装饰器，可以直接通过方法名来访问方法，不需要在方法名后添加一对“（）”

其他知识点

1. Dice 损失类似于交并比，有两个mask，记为X和Y，其Dice损失为$Dice=2\times \frac{X\cap Y}{|X|+|Y|}$
2. WinEdt 中 Tex 编译的快捷键为 ctrl+shift+P，当出现报错信息时 l.30 中字母 l 后面的即出错的行数，输入 e 可以定位到对应的行，输入 Enter 查看下一个错误信息，输入 s 忽略所有报错信息。
3. 变形场（deformation field）是指能使流体在运动中发生形状变化，尤其是伸展（收缩）和切变的速度场。
4. 用 nvidia-smi 命令查看显卡使用情况
5. ubuntu查看版本信息：lsb_release -a，查看 CUDA 版本 nvcc --version 或 cat /usr/local/cuda/version.txt
6. linux 编辑环境变量 vi ~/.bashrc，使环境变量生效 source ~/.bashrc，查看环境变量中的 PATH 等 echo $PATH
7. 远程连接服务器离线跑代码：首先用 sudo apt-get install screen 安装 screen用 screen -S screen名 创建一个 screen，然后运行程序即可，这样就可以关掉连接服务器的软件了。输入 screen -ls 即可查看现有的 screen，输入 screen -r 编号.screen名 就可以重新连接到 screen，需要彻底关闭 screen 时可以使用 kill screen编号即可。在screen界面中，按Ctrl+A然后按Esc键可以用键盘上的方向键和PageUp/PageDown键进行翻页，按Ctrl+C退出。